中國人民解放軍西藏軍區(qū)總醫(yī)院前身是川東軍區(qū)直屬醫(yī)院,1949年11月組建于重慶市長壽縣,1955年更名為陸軍第49醫(yī)院,同年奉命進藏。1962年被命名為西藏軍區(qū)總醫(yī)院,并遷入現址。
醫(yī)院占地面積約41萬余平方米,建筑面積7萬余平方米;編制床位400張,現展開床位550張;編制干部、戰(zhàn)士550人,現有645人;設有4部機關,14個行政科室,29個臨床、醫(yī)技科室,以及全軍高山病防治研究中心、全軍拉薩血站、成都軍區(qū)創(chuàng)傷外科中心、西藏軍區(qū)制劑中心、自治區(qū)醫(yī)學重點實驗室和中西醫(yī)結合研究所;同時為第三軍醫(yī)大學拉薩臨床醫(yī)學院、西藏大學教學醫(yī)院,是集醫(yī)療、科研、教學和保健為一體的三級甲等醫(yī)院。
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